Innodia tutkimus

INNODIA: yleiskatsaus

Vaikka prekliinisissä tyypin 1 diabeteksen tutkimuksissa on tehty huomattavia edistysaskelia, in vitro -malleissa ja eläinkokeissa tehtyjä tärkeitä löydöksiä ei ole vielä voitu muuntaa uusiksi ja tehokkaiksi kliinisiksi interventioiksi, jotka mahdollistaisivat tyypin 1 diabeteksen varhaisemman diagnoosin ja taudin puhkeamisen ja etenemisen estämisen.

INNODIA on kansainvälinen yhteistyöverkosto:

31 Academic

Institutions and clinics

6 EFPIA

Partners

2 Patient

Organization

1 SME

Small and medium sized
enterprise

Annual scientific Reports

Lataa alla oleva PDF:

Mistä Innodiassa on kyse?

Prof. Chantal Mathieu, KU Leuven, INNODIA

INNODIA alan näkökulmasta

Dr. Matthias Loehn, Sanofi

Julkaisut

Uusimmat julkaisut on esitetty nykyisiä julkaisuja käsittelevässä osiossa

Lisätietoja

Lataa alla oleva PDF

Tavoitteet

INNODIA:N KOKONAISTAVOITE

INNODIA:n kokonaistavoitteena on edistyä ratkaisevalla tavalla tyypin 1 diabeteksen kehittymisen ja puhkeamisen ennustamisessa, arvioinnissa ja ehkäisemisessä kehittämällä uusia tutkimusmenetelmiä, kuten biomarkkereita, tautimalleja ja kliinisen tutkimuksen ajatusmalleja. Näiden menetelmien avulla voidaan erottaa ja ymmärtää solu- ja molekyylitasolla tämän heterogeenisen sairauden syntyperää ja etenemisreittejä, mikä vaikuttaa tyypin 1 diabeetikoiden ja sairauden riskiryhmiin kuuluvien henkilöiden tulevaan hoitoon. Tätä tavoitetta varten INNODIA luo kattavan ja monialaisen kliinisten ja perustutkijoiden verkoston, johon kuuluvat tutkijat ovat Euroopan johtavia asiantuntijoita tyypin 1 diabeteksen tutkimuksessa. Verkoston tutkijoilla on lisäksi täydentävää kokemusta immunologian, beetasolujen biologian ja biomarkkerien tutkimuksesta. Verkosto toimii koordinoidusti keskeisten sidosryhmien, erityisesti säätelyviranomaisten ja tyypin 1 diabeetikoiden ja heidän perheidensä kanssa.

Tavoitteet:

Eurooppalaisen infrastruktuurin kehittäminen vastadiagnosoitujen tyypin 1 diabeetikoiden ja heidän riskiryhmään kuuluvien perheenjäsentensä tutkimukseen rekrytoimista, yksityiskohtaista kliinistä fenotyypin määritystä ja biologisten näytteiden ottamista varten.
Perustutkijoiden ja kliinisten tutkijoiden tiiviin yhteistyöverkoston kehittäminen. Verkoston tutkijoiden koordinoitu työskentely beetasolujen autoimmuniteetin ja tyypin 1 diabeteksen patogeneesin paremmin ymmärtämiseksi ja taudin parannuskeinojen löytämiseksi.
Uusien menetelmien kehittämisen ja niiden soveltamisen edistäminen hyödyntämällä keskeisiä vahvuuksiamme bioresurssi- ja omiikkateknologioissa.
Aiemmista tutkimuksista kerätyn ja kliinisistä sekä kokeellisista tutkimuksista peräisin olevan tiedon yhdistäminen sitä varten kehitettävän ainutlaatuisen tietokannan avulla. Se mahdollistaa fenotyypin sekä geneettisten, immunologisten ja metabolisten reittien välisten vuorovaikutusten visualisoinnin ja mallintamisen taudin erilaisten alatyyppien tutkimista varten. Se voi johtaa tyypin 1 diabeteksen syntyperän uudelleenmäärittelyyn ja auttaa kehittämään ehkäisy- ja interventiostrategioita.
Innovatiivisten kliinisten tutkimusasetelmien kehittäminen. Tarkoituksena on hyödyntää uusia validoituja biomarkkereita, jotka mahdollistavat paremmin hoidettavien ryhmiin jakamisen ja toimivat tutkimuksen korvaavina vasteina. Näin saadaan kehitettyä lyhyempiä ja kohdistetumpia yksittäis- tai yhdistelmähoitojen interventiotutkimuksia.

Tieteelliset työryhmät

INNODIA on jaettu kuuteen työryhmään (Work Package - WP), jotka keskittyvät erilaisiin tyypin 1 diabetekseen liittyviin tutkimusaiheisiin. Työryhmillä on omat erilliset hallintorakenteensa, mikä takaa läheisen yhteistyön ja vuorovaikutuksen sekä mahdollistaa tehokkaan tavoitteiden saavuttamisen.

Advisory Boards (Strategic and ethics)

Associates (nPOD,EURADIA, Enpr-EMA)

WP1 Patient cohort studies: High risk and newly diagnosed T1 D- euPOD

WP2 Biomarker Analysis and Validation Core

WP6 Management, Exploitation and Dissemination

WP3 Novel Models and Mechanistic Studies on T1D Pathogenesis

WP4 Systems Biology / In Silico Modelling

WP5 Innovative Clinical
Trials in EU

Patient Advisory Committee (patients and families from different countries, IDF-Europe)

WP1

WP1 kehittää kliinisen infrastruktuurin, jonka avulla voidaan tutkia β-solujen toiminnan muutosten, immuunijärjestelmäprofiilien sekä geneettisten ja ympäristötekijöiden välistä suhdetta tutkittavilla, joilla tyypin 1 diabetes on äskettäin puhjennut, sekä diabeteksen riskiryhmään kuuluvilla henkilöillä. Työryhmä luo biologisten näytteiden standardoituja kokoelmia näytteistä, jotka on saatu suurelta määrältä vastadiagnosoituja tyypin 1 diabeetikoita ja riskiryhmään kuuluvia henkilöitä.

WP1:n keskeiset tavoitteet

WP1 pyrkii hyödyntämään INNODIA:n kliinisten yhteistyökumppanien pääsyä vastadiagnosoitujen tyypin 1 diabeetikoiden, sekä riskiryhmään kuuluvien henkilöiden tietoihin rekisterien ja kansallisen tason yhteistyön avulla ja siten kehittämään uutta eurooppalaista kliinisen tutkimuksen verkostoa.
Tutkittavien soveltuvuutta, tutkimukseen mukaan ottamista, sekä näytteiden keruuta, valmistelua, kuljetusta ja säilytystä koskevien standardoitujen toimintatapojen kehittäminen.
Standardoitujen protokollien kehittäminen perustuen toistuviin C-peptidimittauksiin (myös kotona tehtäviin mittauksiin) ja kattavaan kokoelmaan omiikka-, immuuni-, virus- ja mikrobiomitutkimusten biologisia näytteitä, jotka on kerätty vastadiagnosoiduilta tyypin 1 diabeetikoilta ja diabeteksen riskiryhmään kuuluvilta henkilöiltä.
Kliinisten yhteistyökumppanien jo saatavilla olevien historiallisten tutkimuskohorttien hyödyntäminen, jotta voidaan mallintaa β-solujen toiminnan heikentymistä ja varmentaa biomarkkerit autovasta-ainepositiivisten tutkittavien pitkäaikaisseurannan avulla.
Eurooppalaisen kudosbiopankin luominen onnistuneen JDRFn iPODhankkeen avulla. Sen kautta päästään käsiksi ainutlaatuisiin tyypin 1 diabeetikoiden, diabeteksen riskiryhmään kuuluvien, tyypin 2 diabetesta sairastavien ja terveiden verrokkien haima- ja kudosnäytteisiin.

WP2

WP2 keskittyy tekemään monitasoisia tyypin 1 diabeteksen fenotyyppien analyyseja ja yhdistää niitä erikseen tai integroimalla kliinisiin oireisiin ja sairauden etenemiseen (WP4). Sen tarkoituksena on edistää biomarkkerien löytämistä (yhteistyössä WP3:n kanssa), korvaavien markkerien kehittämistä ja potilaiden jakamista ryhmiin ja siten sairauden heterogeenisyyden ymmärtämistä.

WP2:n keskeiset tavoitteet

Modulaaristen kyselyalustojen kehittäminen tyypin 1 diabeteksen solu- ja molekyylitason ominaisuuksien kuvantamista ja analysointia varten, siltä osin kuin ne liittyvät β-solujen ja immuunisolujen genomeihin, proteomeihin, lipidomeihin ja metabolomeihin.
Tietojoukkomoduulien käyttäminen ja integroiminen tyypin 1 diabeteksen kliiniseen jaotteluun (aikuisiin ja lapsiin, jotka sairastavat tyypin 1 diabetesta, ja korkean sairastumisriskin ryhmiin), jotta voidaan testata ja validoida biologisten näytteiden sarjoja.
Systemaattisen lähestymistavan kehittäminen biomarkkerien löytämiseen validoimalla uusia tautia ennustavia algoritmejä ja ryhmittelijöitä sekä uusia korvikemarkkereita, ymmärtämällä paremmin taudin heterogeenisyyden molekyyli- ja solutason perustaa ja keräämällä parempaa tietoa patogeneesireiteistä.

WP3

WP3 pyrkii kehittämään uusia ja parempia tapoja mallintaa ja seurata sairauden etenemistä sekä arvioida uusien hoitojen vaikutusta hyvin säädellyissä kokeellisissa olosuhteissa. Tämän tavoitteen saavuttamiseksi WP3 käyttää havainto- ja validointikeinoina erityisesti primaarisia ihmiskudoksia (esim. ihmisten saareke- ja immuunisoluja), ihmisten solulinjoja ja humanisoituja hiirimalleja. WP3:ssa ehdotettujen uusien lähestymistapojen tulisi mahdollistaa, että tyypin 1 diabeteksen luonnollista tautihistoriaa ymmärrettäisiin paremmin, ja uusia hoitoja voitaisiin nopeammin siirtää laboratorioista potilaiden hoitoon. WP3:n tulisi mahdollistaa myös mekanistiset selitykset uusien tyypin 1 diabetesta muokkaavien hoitojen onnistumisesta.

WP3:n keskeiset tavoitteet

Kehittää ja varmentaa prekliinisten mallien avulla biomarkkereita ja kuvantamistekniikoita, jotta voidaan arvioida β-solujen tuhoutumista diabeteksen tautiprosessissa sekä uusien hoitojen tuloksia.
β-solujen ja synnynnäisen sekä adaptiivisen immuunijärjestelmän välisen vuorovaikutuksen selventäminen, jotta voidaan kehittää uusia lähestymistapoja sairauden ehkäisemiseksi ja parantamiseksi.
Tyypin 1 diabeteksen heterogeenisen patogeneesin parempi ymmärtäminen siten, että käytetään avuksi sairauden humanisoituja malleja: iPS-pohjaisia β-soluja (muokkaamalla tai muokkaamatta tiettyjä diabeteksen ehdokasgeenejä), ihmisten saareke- ja immuunisoluja sekä uusia ihmisten solulinjoja.
Uusien tyypin 1 diabeteksen ehkäisy- ja parantamiskeinojen testaaminen prekliinisten mallien avulla.

WP4

WP4 tukee INNODIA:a yhdistäviä tavoitteita, jotka koskevat tiedonhallintaa ja integroivien algoritmisten lähestymistapojen kehittämistä sairauden ennustamista ja tutkimista varten. WP4-algoritmit ennustavat ja arvioivat tyypin 1 diabeteksen kehittymistä yhdistämällä muista tämän tutkimuksen työryhmistä saatuja tietoja hyödyntäen niiden monialaisia lähestymistapoja: molekyyligenetiikkaa ja funktionaalista genomiikkaa, solu- ja molekyylibiologiaa, proteomiikkaa, immunologiaa, metabolomiikkaa sekä β-solujen biologiaa yhdessä tutkittavien kliinisen fenotyypin määrityksen kanssa. WP4 luo tiedonhallintainfrastruktuurin, joka tukee yksittäisten tietotyyppien analyysiä sekä tekee integroivia analyysejä, jotka käsittelevät tuloksia tavalla, joka on yhteensopiva muissa työryhmissä käytettyjen tiedontaltiointimallien kanssa.

WP4:n keskeiset tavoitteet

Suojatun tietovarastoympäristön ja palvelinkehyksen kehittäminen ja operoiminen INNODIA:an liittyvien tietojen hallintaa varten.
INNODIA:n tutkimuskumppanien tietohistorian sisällyttäminen tiedon integrointiin sekä olennaisen julkisesti saatavissa olevan tyypin 1 diabetestiedon ja muiden tietojärjestelmien, esim. sähköisten potilaskertomusten ja rekisteritietojen, hyödyntäminen siten, että ne voivat auttaa saamaan selville muiden diabeteksen yhteydessä esiintyvien sairauksien kirjon.
Työkalujen kehittäminen muista työryhmistä saatujen tietojen integroivaa analysointia varten.
Kehittää tietokonemallinnus, jolla pyritään mallintamaan erilaisia sairauden etenemisreittejä, esim. hidasta/nopeaa C-peptidien vähentymistä ja heterogeenisyysmarkkereita.
Sellaisten biomarkkerien ja niiden tunnusmerkkien tunnistaminen, joiden avulla sairastumisriskiä ja sairauden etenemistä ja hoitovastetta voitaisiin ennustaa paremmin.
Tunnistettujen tunnusmerkkien säännöllinen tarkistaminen yhdessä muiden työryhmien kanssa, jotta innovatiivisia tutkimusasetelmia voidaan varmentaa ja toteuttaa (WP5).

WP5

WP5 pyrkii asteittain muuttamaan, miten vastadiagnosoitujen tyypin 1 diabeetikoiden ja diabetesriskiryhmään kuuluvien uusia lääkehoitoja arvioidaan. Se luo EU-alueelle kliinisten tutkimusten verkoston, kehittää uusia tutkimusasetelmamalleja ja arvioi korvikebiomarkkerien käytettävyyttä tyypin 1 diabeteksen kliinisen tutkimuksen tehostamisessa. Nämä strategiat kehitetään varhaisella ja läheisellä yhteistyöllä INNODIA:n akateemisten ja teollisten yhteistyökumppanien ja sidosryhmien, erityisesti säätelyviranomaisten ja tyypin 1 diabeetikoiden, kanssa.

WP5:n keskeiset tavoitteet

Läheistä yhteistyötä tekevän kliinisen tutkimusverkoston kehittäminen yhteistyössä säätelyviranomaisten kanssa.
Kehittää lyhyempiä, tehokkaampia tapoja annoksen, annosvälin ja varhaisen tehon arvioimiseksi vastadiagnosoiduilla tyypin 1 diabeetikoilla ja riskiryhmään kuuluvilla henkilöillä kehittämällä innovatiivisia, hoitovasteen mukaan muutettavia kliinisiä tutkimusasetelmia.
Sellaisen tilastollisen tietokonekoodin kehittäminen, mikä mahdollistaa automaattiset välianalyysit ja mukautetun päätöksenteon.
Sellaisten tutkimusasetelmien kehittäminen, jotka mahdollistavat yhdistelmähoitojen arvioinnin ja tutkittavien ryhmiin jakamisen biomarkkerien perusteella läheisessä yhteistyössä sääntelyviranomaisten kanssa.

WP6

WP6:n kautta hankkeen johto voi hallita tehokkaasti INNODIA-yhteistyöverkostoa ja ohjata hanketta hallinnollisesti. Se tukee INNODIA:n tulosten tiedottamista sekä hyödyntämistä ja on vastuussa sisäisten ja ulkoisten sidosryhmien välisestä vuorovaikutuksesta. WP6 on vastuussa projektinhallinnasta, mikä liittyy kaikkien INNODIA-työsuunnitelmien toteuttamiseen.

WP6:n keskeiset tavoitteet

INNODIA:n tehokkaan yhteistyön varmistaminen.
Tieteellistä, teknologista ja taloudellista kehitystä koskevien raporttien laatiminen IMI JU:n ja IMI:n puitekehyksen vaatimusten mukaisesti.
Yhteistyöverkoston sopimusvelvoitteiden asianmukaisen toteuttamisen takaaminen.
Julkaisukäytäntöjen ja tiedottamissuunnitelmien suunnittelu ja toteutus.
INNODIA:n ulkoisen viestintästrategian suunnittelu ja toteutus yhdessä kaikkien sidosryhmien, potilasjärjestöjen ja lainvalvojien, kanssa.
Tutkimuseettisten asioiden hoitaminen.
Hankkeen riskien valvonta ja tarkkailu sekä tarvittaessa korjaustoimien ehdottaminen.

Consortium

40 partner

map

31 ACADEMIC
institutions and clinics
6 EFPIA
PARTNERS
2 PATIENT
organizatioN
1 SME
SMALL and MEDIUM SIZED
ENTERPRISE

For more information select one of the following partners

UD'A
UNISI
UPI
UniSR
OPBG
CHL
OUS
SUM
UL
UNIL
UCAM
KCL
UOXF
CU
UNEXE

EFPIA

Sanofi
Novo Nordisk
Eli Lilly
GSK
Imcyse
Novartis

SME

Univercell-Biosolutions

Foundations

JDRF
HCT

Innodia tutkimus

INNODIA: yleiskatsaus

31 Academic

6 EFPIA

2 Patient

1 SME

Annual scientific Reports

Mistä Innodiassa on kyse?

INNODIA alan näkökulmasta

Julkaisut

Lisätietoja

Tavoitteet

INNODIA:N KOKONAISTAVOITE

Tavoitteet:

Tieteelliset työryhmät

Tieteelliset työryhmät

WP1

WP1:n keskeiset tavoitteet

WP2

WP2:n keskeiset tavoitteet

WP3

WP3:n keskeiset tavoitteet

WP4

WP4:n keskeiset tavoitteet

WP5

WP5:n keskeiset tavoitteet

WP6

WP6:n keskeiset tavoitteet

Consortium

40 partner

map

31 ACADEMIC

6 EFPIA

2 PATIENT

1 SME

Academic partners

EFPIA

SME

Foundations